Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KC1Q96S38 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms