Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUDCD1Q96RS6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms