Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CICQ96RK0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CICQ96RK0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms