Protein–RNA interactions for Protein: Q96QU6

ACCS, 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACCSQ96QU6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms