Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NLRP3Q96P20 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NLRP3Q96P20 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NLRP3Q96P20 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NLRP3Q96P20 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NLRP3Q96P20 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NLRP3Q96P20 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NLRP3Q96P20 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NLRP3Q96P20 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NLRP3Q96P20 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NLRP3Q96P20 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NLRP3Q96P20 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NLRP3Q96P20 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NLRP3Q96P20 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NLRP3Q96P20 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NLRP3Q96P20 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NLRP3Q96P20 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NLRP3Q96P20 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NLRP3Q96P20 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NLRP3Q96P20 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NLRP3Q96P20 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NLRP3Q96P20 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NLRP3Q96P20 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NLRP3Q96P20 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NLRP3Q96P20 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP3Q96P20 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP3Q96P20 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP3Q96P20 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP3Q96P20 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP3Q96P20 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP3Q96P20 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP3Q96P20 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP3Q96P20 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP3Q96P20 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP3Q96P20 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NLRP3Q96P20 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms