Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EP400Q96L91 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EP400Q96L91 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EP400Q96L91 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms