Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHACTR3Q96KR7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHACTR3Q96KR7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms