Protein–RNA interactions for Protein: Q96KK3

KCNS1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1Q96KK3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNS1Q96KK3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNS1Q96KK3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms