Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM87BQ96K49 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM87BQ96K49 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.3 ms