Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCHS1Q96JQ0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms