Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
COG3Q96JB2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
COG3Q96JB2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms