Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MRPL53Q96EL3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms