Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC39Q96DD0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC39Q96DD0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms