Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM63Q969Q1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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