Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TNRQ92752 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TNRQ92752 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TNRQ92752 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TNRQ92752 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TNRQ92752 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TNRQ92752 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TNRQ92752 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TNRQ92752 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TNRQ92752 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TNRQ92752 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TNRQ92752 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TNRQ92752 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TNRQ92752 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TNRQ92752 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TNRQ92752 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TNRQ92752 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TNRQ92752 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TNRQ92752 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TNRQ92752 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TNRQ92752 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
TNRQ92752 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TNRQ92752 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TNRQ92752 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TNRQ92752 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TNRQ92752 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TNRQ92752 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TNRQ92752 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TNRQ92752 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TNRQ92752 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TNRQ92752 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TNRQ92752 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TNRQ92752 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TNRQ92752 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TNRQ92752 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TNRQ92752 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TNRQ92752 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TNRQ92752 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TNRQ92752 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TNRQ92752 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TNRQ92752 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TNRQ92752 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TNRQ92752 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TNRQ92752 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TNRQ92752 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
TNRQ92752 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TNRQ92752 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TNRQ92752 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TNRQ92752 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TNRQ92752 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TNRQ92752 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
TNRQ92752 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TNRQ92752 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TNRQ92752 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TNRQ92752 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TNRQ92752 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TNRQ92752 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TNRQ92752 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
TNRQ92752 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TNRQ92752 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TNRQ92752 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TNRQ92752 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TNRQ92752 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TNRQ92752 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TNRQ92752 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TNRQ92752 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
TNRQ92752 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TNRQ92752 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TNRQ92752 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TNRQ92752 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TNRQ92752 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TNRQ92752 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TNRQ92752 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TNRQ92752 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TNRQ92752 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TNRQ92752 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TNRQ92752 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TNRQ92752 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TNRQ92752 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TNRQ92752 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TNRQ92752 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TNRQ92752 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TNRQ92752 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TNRQ92752 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TNRQ92752 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TNRQ92752 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TNRQ92752 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TNRQ92752 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
TNRQ92752 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TNRQ92752 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TNRQ92752 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TNRQ92752 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TNRQ92752 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TNRQ92752 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TNRQ92752 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
TNRQ92752 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TNRQ92752 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TNRQ92752 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TNRQ92752 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
TNRQ92752 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms