Protein–RNA interactions for Protein: Q92611

EDEM1, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM1Q92611 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM1Q92611 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms