Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ19

KCTD13, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD13Q8WZ19 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD13Q8WZ19 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.3 ms