Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CASKIN2Q8WXE0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASKIN2Q8WXE0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms