Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HELBQ8NG08 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HELBQ8NG08 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms