Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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