Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMG8Q8ND04 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG8Q8ND04 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms