Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J3

RGPD4, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4Q7Z3J3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD4Q7Z3J3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD4Q7Z3J3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD4Q7Z3J3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD4Q7Z3J3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD4Q7Z3J3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD4Q7Z3J3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD4Q7Z3J3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD4Q7Z3J3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD4Q7Z3J3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD4Q7Z3J3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD4Q7Z3J3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD4Q7Z3J3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD4Q7Z3J3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD4Q7Z3J3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD4Q7Z3J3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD4Q7Z3J3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD4Q7Z3J3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD4Q7Z3J3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD4Q7Z3J3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD4Q7Z3J3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD4Q7Z3J3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD4Q7Z3J3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD4Q7Z3J3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD4Q7Z3J3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD4Q7Z3J3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD4Q7Z3J3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD4Q7Z3J3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RGPD4Q7Z3J3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
RGPD4Q7Z3J3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
RGPD4Q7Z3J3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RGPD4Q7Z3J3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms