Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
XIRP1Q702N8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
XIRP1Q702N8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
XIRP1Q702N8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
XIRP1Q702N8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
XIRP1Q702N8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
XIRP1Q702N8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
XIRP1Q702N8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
XIRP1Q702N8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
XIRP1Q702N8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
XIRP1Q702N8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
XIRP1Q702N8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
XIRP1Q702N8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
XIRP1Q702N8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
XIRP1Q702N8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
XIRP1Q702N8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
XIRP1Q702N8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
XIRP1Q702N8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
XIRP1Q702N8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
XIRP1Q702N8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
XIRP1Q702N8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
XIRP1Q702N8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
XIRP1Q702N8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
XIRP1Q702N8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
XIRP1Q702N8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
XIRP1Q702N8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
XIRP1Q702N8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
XIRP1Q702N8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
XIRP1Q702N8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
XIRP1Q702N8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
XIRP1Q702N8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
XIRP1Q702N8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
XIRP1Q702N8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
XIRP1Q702N8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
XIRP1Q702N8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
XIRP1Q702N8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
XIRP1Q702N8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
XIRP1Q702N8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
XIRP1Q702N8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
XIRP1Q702N8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
XIRP1Q702N8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
XIRP1Q702N8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
XIRP1Q702N8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
XIRP1Q702N8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms