Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSY5

PPP1R3F, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3FQ6ZSY5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP1R3FQ6ZSY5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPP1R3FQ6ZSY5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPP1R3FQ6ZSY5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPP1R3FQ6ZSY5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP1R3FQ6ZSY5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP1R3FQ6ZSY5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP1R3FQ6ZSY5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP1R3FQ6ZSY5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP1R3FQ6ZSY5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP1R3FQ6ZSY5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP1R3FQ6ZSY5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP1R3FQ6ZSY5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms