Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPN12Q6ZSI9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN12Q6ZSI9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms