Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC129Q6ZRS4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC129Q6ZRS4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC129Q6ZRS4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms