Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NSMFQ6X4W1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms