Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGMBQ6NW40 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RGMBQ6NW40 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms