Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CARMIL1Q5VZK9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CARMIL1Q5VZK9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms