Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR78Q5VTH9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms