Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP2LQ5T4T6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP2LQ5T4T6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms