Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CC2D1BQ5T0F9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CC2D1BQ5T0F9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CC2D1BQ5T0F9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CC2D1BQ5T0F9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CC2D1BQ5T0F9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CC2D1BQ5T0F9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CC2D1BQ5T0F9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CC2D1BQ5T0F9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CC2D1BQ5T0F9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CC2D1BQ5T0F9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CC2D1BQ5T0F9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CC2D1BQ5T0F9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CC2D1BQ5T0F9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CC2D1BQ5T0F9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CC2D1BQ5T0F9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CC2D1BQ5T0F9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CC2D1BQ5T0F9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CC2D1BQ5T0F9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CC2D1BQ5T0F9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CC2D1BQ5T0F9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CC2D1BQ5T0F9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CC2D1BQ5T0F9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CC2D1BQ5T0F9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CC2D1BQ5T0F9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CC2D1BQ5T0F9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CC2D1BQ5T0F9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CC2D1BQ5T0F9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CC2D1BQ5T0F9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CC2D1BQ5T0F9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CC2D1BQ5T0F9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms