Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP188Q5SRE5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
NUP188Q5SRE5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms