Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTC6

AMER1, APC membrane recruitment protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER1Q5JTC6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AMER1Q5JTC6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
AMER1Q5JTC6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AMER1Q5JTC6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AMER1Q5JTC6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
AMER1Q5JTC6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
AMER1Q5JTC6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
AMER1Q5JTC6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
AMER1Q5JTC6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
AMER1Q5JTC6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
AMER1Q5JTC6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
AMER1Q5JTC6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
AMER1Q5JTC6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
AMER1Q5JTC6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
AMER1Q5JTC6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
AMER1Q5JTC6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
AMER1Q5JTC6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
AMER1Q5JTC6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
AMER1Q5JTC6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
AMER1Q5JTC6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
AMER1Q5JTC6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
AMER1Q5JTC6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
AMER1Q5JTC6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
AMER1Q5JTC6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
AMER1Q5JTC6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms