Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC9

AKAP4, A-kinase anchor protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP4Q5JQC9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
AKAP4Q5JQC9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
AKAP4Q5JQC9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AKAP4Q5JQC9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
AKAP4Q5JQC9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
AKAP4Q5JQC9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
AKAP4Q5JQC9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
AKAP4Q5JQC9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
AKAP4Q5JQC9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
AKAP4Q5JQC9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AKAP4Q5JQC9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
AKAP4Q5JQC9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AKAP4Q5JQC9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AKAP4Q5JQC9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
AKAP4Q5JQC9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AKAP4Q5JQC9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AKAP4Q5JQC9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
AKAP4Q5JQC9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AKAP4Q5JQC9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
AKAP4Q5JQC9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
AKAP4Q5JQC9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
AKAP4Q5JQC9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AKAP4Q5JQC9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
AKAP4Q5JQC9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
AKAP4Q5JQC9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AKAP4Q5JQC9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
AKAP4Q5JQC9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AKAP4Q5JQC9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms