Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
XKR3Q5GH77 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XKR3Q5GH77 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms