Protein–RNA interactions for Protein: Q5D1E8

ZC3H12A, Endoribonuclease ZC3H12A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12AQ5D1E8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZC3H12AQ5D1E8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZC3H12AQ5D1E8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZC3H12AQ5D1E8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZC3H12AQ5D1E8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12AQ5D1E8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12AQ5D1E8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12AQ5D1E8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12AQ5D1E8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12AQ5D1E8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12AQ5D1E8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12AQ5D1E8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12AQ5D1E8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12AQ5D1E8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12AQ5D1E8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12AQ5D1E8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12AQ5D1E8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12AQ5D1E8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC3H12AQ5D1E8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12AQ5D1E8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12AQ5D1E8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12AQ5D1E8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12AQ5D1E8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12AQ5D1E8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12AQ5D1E8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12AQ5D1E8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12AQ5D1E8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12AQ5D1E8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12AQ5D1E8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12AQ5D1E8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12AQ5D1E8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12AQ5D1E8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZC3H12AQ5D1E8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZC3H12AQ5D1E8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZC3H12AQ5D1E8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZC3H12AQ5D1E8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZC3H12AQ5D1E8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms