Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAN3Q58A45 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAN3Q58A45 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAN3Q58A45 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PAN3Q58A45 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAN3Q58A45 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAN3Q58A45 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAN3Q58A45 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAN3Q58A45 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAN3Q58A45 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAN3Q58A45 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAN3Q58A45 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAN3Q58A45 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAN3Q58A45 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAN3Q58A45 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAN3Q58A45 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAN3Q58A45 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAN3Q58A45 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAN3Q58A45 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAN3Q58A45 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAN3Q58A45 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAN3Q58A45 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAN3Q58A45 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAN3Q58A45 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAN3Q58A45 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAN3Q58A45 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAN3Q58A45 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAN3Q58A45 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAN3Q58A45 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAN3Q58A45 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAN3Q58A45 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAN3Q58A45 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAN3Q58A45 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAN3Q58A45 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms