Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD55Q3KP44 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD55Q3KP44 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD55Q3KP44 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD55Q3KP44 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms