Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CSPP1Q1MSJ5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms