Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
FOXD1Q16676 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
FOXD1Q16676 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
FOXD1Q16676 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
FOXD1Q16676 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
FOXD1Q16676 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
FOXD1Q16676 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
FOXD1Q16676 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
FOXD1Q16676 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
FOXD1Q16676 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
FOXD1Q16676 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
FOXD1Q16676 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
FOXD1Q16676 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
FOXD1Q16676 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC31.1■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
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FOXD1Q16676 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
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FOXD1Q16676 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
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FOXD1Q16676 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
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FOXD1Q16676 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
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FOXD1Q16676 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 GAPDHP74-202ENST00000632456 782 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
FOXD1Q16676 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
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FOXD1Q16676 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.07■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 AC022148.2-201ENST00000586176 560 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
FOXD1Q16676 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
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