Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MRPL23Q16540 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms