Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SURF1Q15526 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
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