Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDSNQ15517 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDSNQ15517 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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