Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NKX1-1Q15270 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NKX1-1Q15270 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms