Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDCD1Q15116 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
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