Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
HERC3Q15034 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HERC3Q15034 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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