Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
NWD1Q149M9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NWD1Q149M9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
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