Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HNF4GQ14541 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HNF4GQ14541 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms