Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTTNQ14247 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTTNQ14247 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTTNQ14247 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTTNQ14247 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CTTNQ14247 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTTNQ14247 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTTNQ14247 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTTNQ14247 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTTNQ14247 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTTNQ14247 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTTNQ14247 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTTNQ14247 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTTNQ14247 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTTNQ14247 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTTNQ14247 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTTNQ14247 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTTNQ14247 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTTNQ14247 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTTNQ14247 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CTTNQ14247 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTTNQ14247 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTTNQ14247 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTTNQ14247 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CTTNQ14247 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTTNQ14247 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTTNQ14247 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTTNQ14247 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTTNQ14247 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTTNQ14247 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTTNQ14247 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTTNQ14247 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CTTNQ14247 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTTNQ14247 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms